承包人施工中发现文物应当谨慎应对，一旦处理不当，不仅会影响工程进度，如果造成文物的毁坏，还可能被行政部门严厉处罚。实践中，如果双方在建设工程施工合同中没有对文物保护明确约定，承包人应当按以下方式处理：

（1）承包人立即停止施工并保护现场，并将情况书面形式通知发包人，由发包人报告给当地文物行政部门，承包人按文物部门的要求采取保护措施，由此发生的费用由发包人承担，同时向发包人提出索赔意向。

（2）积极与文物行政管理部门沟通，了解该文物的发现对于整个项目正常进行可能造成的影响评估，以及由此可能产生的不利局面，并拟定初步索赔方案。

（3）保护现场的同时，应根据现场文物解决方案的时间需要和方案判断，统筹协调现场人力物力资源配置，避免损失进一步扩大。

（4）根据文物部门的答复，计算此事件对自身造成的损失并制定详细的索赔报告，向发包人提出索赔。

（5）如果因发现文物导致施工方案发生重大改变等情况，承包人可以据此考虑解除合同，并要求发包人赔偿损失。